# Settings

## Nastavení panelů

V rámci kteréhokoliv panelu lze uložit a zpět načíst použité nastavení pomocí '`Ctrl+S`' resp. '`Ctrl+O`'. Je-li uložení provedeno na nějakém panelu, je uloženo i nastavení všech předcházejících panelů. Při načítání nastavení se vymaže a následně načte nastavení aktuálního a následujících panelů (t.j. nelze tak např. sloučit dva soubory nastavení), nastavení již schválených panelů není ovlivněno.

V případě panelu výsledků se při ukládání ukládají i výsledky. (Co s načítáním výsledků? Problém, že v souboru budou již pouze zaokrouhlené hodnoty.) Při načítání se v panelu výsledků načtou pouze filtry a aktuálně použité filtry se, nejsou-li totožné, deaktivují (t.j. nejsou ztraceny). Filtry nejsou aktivovány automaticky, je nutné otevřít okno filtrů a potvrdit je.

## Editace databází

Po editaci databáze (prvky `Ctrl+E`, aminokyseliny [skryté], proteázy `Ctrl+P`, modifikace `Ctrl+M`, můstky `Ctrl+B`, formáty `Ctrl+F`) se doporučuje provést kontrola, resp. znovuvložení objektů, které by to mohlo ovlivnit, protože může dojít k nekonzistentním stavům, kdy některé objekty jsou ovlivněny a některé nikoliv. Proto se program po uložení vrátí na první z panelů, který mohl být ovlivněn. (První od začátku, nikoliv první při postupu od aktuálního stavu.) Při ukládání db do souborů se používá univerzální formát čísel (desetinná tečka, bez oddělovače řádů), nikoliv národní nastavení, jsou tak snadno přenositelná. Oproti tomu v případě nastavení výpočtu/ výsledků se používá národní nastavení, takže soubor nemusí být přenositelný, pokud mají lokalizace např. jiný desetinný oddělovač nebo separátor řádů. (Pozor na to, že textový soubor může být v různých formátech a tak mezera nemusí být mezera - např nezalomitelná mezera. %-)

## Speciální nastavení

- Formát čísel: jazyk, alternativně 1, alternativně 2 (desetinný separátor, separátor tisíců...).
- Samostatně počty desetinných cifer pro zobrazení (a) hmoty a změny hmoty, (b) chybu v ppm, (c) chyba v Da (Možná definovat i počet znaků intenzity?).
- Rozpoznávání formátu měření: Zda má být formát přiřazen automaticky, nebo zda má být přiřazení potvrzováno. Je-li zvoleno více souborů, je primárně hledán formát vyhovující všem souborů.
- Zalamování nastavení: Zda zalamovat nastavení ve shrnutí na panelu výsledků.
- Alternativy - max. počet záložek: Pokud jsou hledány alternativy pro nejvýše m hmot, je každá zobrazena v samostatném panelu. Je-li hmot více, jsou výsledky sloučeny do jednoho panelu.